核苷酸水平上對自然選擇作用的檢驗及人CDYL基因中兩個新外顯子起源與進化的研究.pdf

1、　　非編碼區(qū)序列在基因表達調控中起著重要作用，但其在進化過程中是否受到選擇作用一直較難檢測。最近有一些研究使用平均的核苷酸替換速率與中性序列的核苷酸替換速率的比值(ω)作為檢測非編碼區(qū)選擇作用的指標。ω＜1，ω=1或者ω＞1分別被作為純化選擇，中性進化和正選擇的指示。但是，對于非編碼區(qū)而言，了解具體哪一些核苷酸受到選擇作用更具有意義。本研究借鑒Yang等檢測單個氨基酸位點是否受選擇作用的思路，在最大似然法的模型下，提出一種在核苷酸位點水

2、平上對自然選擇作用檢測的方法。研究結果表明：　　1.本方法能夠檢測在進化過程中對功能分化有重要貢獻的核苷酸位點，包括編碼和非編碼區(qū)?！　?.將此方法應用到對HIV-1的包裝蛋白基因正選擇位點的分析，結果與用Yang的方法所得到的結果極其相似，說明我們的方法能有效檢測受到正選擇的編碼蛋白基因。　　3.將此方法同時應用到對非編碼區(qū)的分析，我們以CTGF基因的5'UTR為例，結果表明此方法對非編碼區(qū)中受到正選擇的位點的分析同樣有效?！?/p>

3、　經過多年的研究，人們對基因起源和進化規(guī)律已開始有了一些初步的了解，已經知道物種間基因的數(shù)目上存在著如此巨大的變化，多種分子機制參與了新基因的形成，并且新基因在群體中的固定是受到自然選擇作用的。而外顯子，它作為基因結構的基本單位，它的起源與進化的研究相對于對新基因的研究還不多，人們對它起源的分子基因與進化力量還不清楚。然而我們知道，在高等生物中，選擇性剪切是一種非常重要的產生多樣性的手段，能使得生物體已較小的變化與較低的代價獲得某些新的

4、蛋白與調控方式。因此研究新外顯子的起源與進化也是十分重要的進化生物學的領域。本研究通過人，鼠和豬的同源序列比對，鑒定出了人CDYL基因中新近起源的兩個具有編碼功能的外顯子。試圖通過對新近起源外顯子的研究對外顯子起源與進化的規(guī)律作以初步探討。研究結果表明：　　1.人CDYL基因最長的剪切形式，即剪切形式a的第二和第三外顯子，分別記為外顯子2和外顯子3，是新近起源的編碼蛋白的外顯子。　　2.新外顯子在人中發(fā)生快速的進化，并且這種快速的進