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文檔簡介
1、建立基于Web的藥物專利檢索系統(tǒng)的核心問題是藥物專利中采用的族性結構的計算機表示方法的問題.該論文系統(tǒng)的回顧了國內外族性結構處理的發(fā)展和現(xiàn)狀,吸取眾家之長,提出了族性結構新的表達方案——數字編碼,從藥物分子的角度探討了數字編碼的理論基礎.該處理方案首先利用SMILES線笥編碼程序對環(huán)和非環(huán)原子,特別是對芳香環(huán)原子的識別算法,實現(xiàn)了結構式的程序拆分,打斷結構式中原子和鍵的連接關系,將結構式拆分成Ring和Fragment兩類結構片斷,利用
2、生成全結構SMILES編碼的算法生成Ring和Fragment的唯一SMILES編碼;其次,從結構片斷編碼中提取結構信息,用數字表示Ring和Fragment的類型和屬性得到Ring和Fragment的數字編碼表達式;最后,分別按照預先定義的Ring和Fragment的優(yōu)先級別排列組合Ring和Fragment的數字編碼就是全結構的數字編碼表達式,重新構建了原結構原子和鍵的連接關系.數字編碼將確定結構族性化表示,將族性結構適當展開,用有
3、限的數字編碼表示可能包含有成百上千個確定結構的族性結構.用面向對象程序設計方法(OOP)實現(xiàn)了數字編碼方案的一系列算法,用Java語言完成了能夠運行于網頁的Applet程序StruDraw,對提問結構式用該程序實現(xiàn)了結構的拆分和數字編碼.由于數字編碼規(guī)則簡單,適用于藥物專利標引,建立供檢索的藥物專利數據庫.該論文基于Windows2000+ⅡS5.0平臺設計并實現(xiàn)了基于Web的藥物專利檢索系統(tǒng),能夠提供確定結構檢索確定和族性結構,族性結
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