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文檔簡介
1、目的:
本文主要介紹高維數據下半參數可加危險率模型中基于ISIS的變量選擇方法,并探討AHAZISIS模型,AHAZLASSOISIS模型,AHAZENISIS模型,AHAZSSCADISIS模型在高維數據生存分析中的優(yōu)劣。從而揭示死亡或其他生存結局發(fā)生的時間與基因表達之間的關系,從基因層面上為疾病的診療和預后以及改進治療方案提供依據。
方法:
介紹AHAZISIS模型,AHAZLASSOISIS模型,AH
2、AZENISIS模型和AHAZSSCADISIS模型的基本方法原理。針對生物信息學高維度,強相關,小樣本量的數據特征進行數據模擬,并比較四種模型在不同模擬數據下的表現情況。最后利用來源于TCGA的前列腺癌數據進行實證研究。
結果:
?、俑鞣N模擬數據情形下,三種初次懲罰函數的模擬結果在一致性和精確性的表現上差別不大。
?、诟鞣N數據情形下,四種再次懲罰函數在一致性方面OS-SCAD表現最好,SSCAD次之,Lass
3、o第三,EN表現最差;而在精確性方面,OS-SCAD和SSCAD較好,Lasso次之,EN表現最差。
?、鄹鞣N數據情形下,再次懲罰函數SSCAD的不同steps在一致性方面,steps=1表現最好,steps=2,3,4,5比較接近;在精確性方面,steps=1表現最差,steps=2,3,4,5比較接近。
?、苋N初次懲罰函數,四種再次函數以及再次懲罰函數SSCAD的不同steps在精確性方面與協(xié)變量相關系數大小呈負相
4、關,即相關系數較小則精確性高,反之精確性則低。
?、軦HAZISIS模型、AHAZSSCADISIS模型在實證研究中篩選出基因數目少,模型可解釋性較好。根據log-rank檢驗的p值大小,AHAZISIS模型、AHAZSSCADISIS模型在實證研究中預測能力方面表現較好。
結論:
在模擬研究和實證研究中,各模型表現一致。AHAZISIS模型和AHAZSSCADISIS模型的模型解釋性較好,估計精確性也較高,
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