基于表達調控相關蛋白的結構和功能的研究.pdf

1、生物體內許多重要的生物學過程受到嚴格的調控，如細胞生長調控，DNA損傷修復和蛋白質的泛素化等。這些生物學事件都涉及到基因表達的調控。基因表達的調控要求許多蛋白質和蛋白質復合物的參與。我們挑選了幾個與基因表達調控相關的蛋白質進行研究，這幾個蛋白質的溶液結構通過核磁共振的方法獲得，并進行了生物學作用的研究。這篇論文共分為5個部分。
　　 1.YEATS domain作為一個新穎而保守的蛋白質結構域家族在從酵母到人的很多生物中發(fā)現(xiàn)。T

2、af14 YEATS domain呈現(xiàn)一個β三明治式的構型。結構比較發(fā)現(xiàn)Taf14 YEATS domain和Yaf9 YEATS domain在一些方面存在很大的差異，暗示著YEATS domain家族可能存在著不同的結構亞型。酵母細胞內功能的研究證明在外界的壓力環(huán)境下Taf14 YEATS domain抑制細胞的生長。此外，Taf14的C末端與轉錄因子Sth1相互作用，而Sth1是RSC蛋白質復合物中必不可少的元件。所有這些數(shù)據(jù)暗示

3、著Taf14參與酵母細胞的轉錄激活調節(jié)過程，而Taf14YEATS domain對于酵母細胞的生長起著負調控作用。
　　 2.N末端含有一個BRCT domain的Rap1在酵母細胞內發(fā)揮著很多作用，如控制端粒的復制以及參與糖分解和核糖體蛋白基因的激活。我們解析了Rap1BRCT domain的溶液結構。結構的比較顯示Rap1 BRCT domain擁有和其它BRCT domains相似的構型，同時Rap1 BRCT domai

4、n展示了一些不同于其它BRCT domains的結構特征，這些特征揭示了一個新穎的BRCT domain構型。
　　 3.Urm1是一個泛素類似蛋白質。我們解析了錐體蟲中Urm1的溶液結構，結構的比較顯示TbUrm1擁有泛素類似蛋白家族的結構特征，同時TbUrm1擁有和原核生物泛素類似蛋白MoaD相似的結構，這些證據(jù)支持Urm1作為一個獨一無二的分子化石揭示了泛素類似蛋白家族的進化過程。
　　 4.SAMP1和SAMP2

5、是新發(fā)現(xiàn)的古細菌中的泛素類似蛋白。NMR實驗證明SAMP1和SAMP2在低鹽的環(huán)境下分別擁有兩套構象，即有結構的構象和無規(guī)構象。但是在高鹽的環(huán)境下它們只保留了一套構象，即有結構的構象。同時研究發(fā)現(xiàn)SAMP1能夠與蛋白酶亞基分子PanA和PanB結合，這表明SAMP1可能參與古細菌中泛素調控的蛋白質降解過程。這個課題由我，廖善輝和范楷三個人共同完成，我負責蛋白質溶液結構的解析和核磁數(shù)據(jù)的分析。
　　 5.在酵母細胞中，Set9催化