影響蛋白質折疊速率因素的統(tǒng)計分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、蛋白質可以自發(fā)地從不穩(wěn)定的變性態(tài)快速而精確地折疊到它特有的穩(wěn)定天然態(tài)。精確地預測蛋白質折疊速率是理解蛋白質結構和蛋白質折疊機制的關鍵突破口,也是現代分子生物學研究的重要內容之一,而找出決定蛋白質折疊速率的核心因素將為實現折疊速率的準確預測提供保證?,F有的研究結果表明,影響蛋白質折疊速率的主要因素可以概括為三個方面:蛋白質鏈長、結構拓撲、氨基酸組分及其物化性質。在驅動蛋白質從變性態(tài)折疊到它獨特的天然態(tài)的過程中,主鏈扭角偏好性和疏水相互作用

2、扮演了重要角色。定義了表示主鏈扭角偏好性的參數——累積扭角,以及表示疏水相互作用的參數——疏水殘基埋藏面積,分別統(tǒng)計分析了它們對折疊速率的影響。
  結果表明:1)累積扭角和疏水殘基埋藏面積是蛋白質折疊速率的決定因素;2)從氨基酸序列預測的主鏈扭角出發(fā),可以發(fā)展基于氨基酸序列的蛋白質折疊速率預測模型;3)主鏈累積扭角中除長度信息以外,影響蛋白質折疊速率的信息主要分布在 beta片結構以及轉角(或無規(guī)則卷曲)結構中;4)累積扭角表現

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