基于oncomine和qPCR篩選高度鱗狀上皮內病變相關基因.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的：利用Oncomine數(shù)據(jù)庫篩選在宮頸鱗癌患者中高表達的基因，用實時熒光定量PCR(Real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction，qPCR)技術比較這些基因在高度鱗狀上皮內病變(HSIL)患者中的表達情況，尋找表達異常的基因，探索與早期宮頸癌相關的基因。
　　方法：利用Oncomine數(shù)據(jù)庫挖掘在宮頸鱗癌中高表達的基因，加權計算后，重新排序，篩選出表達

2、差異顯著的基因;選擇本地區(qū)12例高度鱗狀上皮內病變(HSIL)病人，均行宮頸錐切術治療，在已切下的宮頸組織中，分別選擇病變組織和正常的宮頸組織，分別提取組織中的RNA，逆轉錄成cDNA，采用qPCR技術檢測，以公式:2ΔΔCt=2ΔCt病變組織/2ΔCt正常組織（Ct值是指反應時收集的實時熒光強度達到設定閾值時所經歷的擴增循環(huán)數(shù)）計算各基因表達的差異倍數(shù)，并用配對t檢驗，對比其在宮頸鱗癌病人中的表達。
　　結果：在Oncomine

3、數(shù)據(jù)庫中挖掘出8個(MMP1，SPP1，APOC1，MMP12，NEK2，ECT2， IDO1，HELLS)在宮頸鱗癌病人中高表達的基因;在HSIL病人中，通過qPCR技術檢測及數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析后，發(fā)現(xiàn)有7個在宮頸鱗癌中高表達的基因(MMP1，SPP1，APOC1，MMP12，ECT2， IDO1，HELLS)，在HSIL病人中同樣呈高表達，差異具有統(tǒng)計學意義(P＜0.05)，只有一個基因(NEK2)在本次實驗的HSIL病人中表達無差異。<

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