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文檔簡介
1、胃癌是我國及世界上最常見的惡性腫瘤之一,胃癌患者的預后較差。浸潤轉(zhuǎn)移是胃癌的一個重要特征,常導致患者預后不良。揭示胃癌浸潤轉(zhuǎn)移的分子機制是胃癌基礎和臨床研究的重要課題。
除了基因?qū)W的改變以外,非編碼RNA特別是microRNA(miRNA,miR),對腫瘤的發(fā)生發(fā)展、浸潤轉(zhuǎn)移也發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。miRNA是一類內(nèi)生性的、長度約19-25個核苷酸的小RNA,主要是通過與靶基因mRNA的3'非翻譯區(qū)(3'-UTR)結(jié)合,降解靶
2、mRNA或抑制靶蛋白的翻譯,廣泛參與增殖、凋亡、發(fā)育、分化等多種生物學過程,在人類疾病包括腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。而目前尚未見miR-214在胃癌中的詳細研究。
本研究擬在人胃癌組織及細胞系中檢測miR-214的表達情況,進行miR-214功能學實驗以探究其生物學作用,并鑒定其調(diào)控的靶基因。預測軟件提示cAMPresponsive element binding protein1(CREB1,cAMP反應元件結(jié)合蛋白)
3、可能是miR-214的一個靶基因,本課題擬初步探究CREB1在胃癌中的表達、功能及分子機制,以期為胃癌的診斷和治療提供新的方法和靶點。
第一部分胃癌中miR-214表達的臨床意義及其對胃癌細胞生物學行為的影響
研究目的:
1.檢測miR-214在胃癌組織及細胞中的表達情況。
2.分析miR-214與臨床病理參數(shù)及患者預后的關系。
3.探究miR-214對胃癌細胞浸潤轉(zhuǎn)移及增殖、凋亡的影響
4、。
4.鑒定miR-214直接調(diào)控的靶基因。
研究方法:
1.使用實時定量PCR檢測80例胃癌組織和18例非腫瘤胃黏膜組織及4種胃癌細胞株(MKN28、BGC823、MKN45及SGC7901)、1種非腫瘤的永生化細胞株GES-1中miR-214的表達情況。
2.收集患者臨床資料及隨訪信息,分析miR-214與腫瘤直徑、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等臨床病理參數(shù)的關系。Kaplan-Meier法及Log-rank檢
5、驗分析miR-214的預后價值。
3.胃癌細胞轉(zhuǎn)染LV3-hsa-miR-214(過表達)、miR-214 inhibitor(抑制劑)及Negative control(陰性對照)后,進行細胞遷移浸潤和增殖、凋亡實驗來驗證其生物學功能。
4.使用TargetScan軟件預測miR-214的靶基因,通過熒光素酶檢測和Western blot實驗,驗證miR-214調(diào)控的直接靶基因。
結(jié)果:
1.8
6、0例胃癌組織中miR-214的表達水平較18例非腫瘤胃黏膜組織下調(diào)約6倍,在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的胃癌組織中下調(diào)更明顯。同時,4種胃癌細胞中miR-214的表達水平較非腫瘤胃粘膜組織也呈現(xiàn)不同程度的下調(diào)。
2.miR-214的表達與腫瘤直徑及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈負相關。然而生存分析顯示miR-214對患者的預后無明顯影響。
3.miR-214可抑制胃癌細胞的增殖、遷移浸潤能力,而對細胞凋亡無明顯作用。
4.靶基因軟件Tar
7、getScan預測提示FGFR1、CSF1、NOTCH2、CREB1、AGAP2等是miR-214的潛在靶基因。熒光素酶實驗和Western blot證實CSF1是miR-214的直接靶基因。
結(jié)論及意義:
miR-214在胃癌組織和多種胃癌細胞系中表達下調(diào),在轉(zhuǎn)移性的胃癌組織中降低更明顯。miR-214可抑制胃癌細胞的增殖、遷移浸潤能力,而對細胞凋亡無明顯影響。CSF1是miR-214的直接靶基因。miR-214對
8、其它靶基因(如CREB1等)的調(diào)控作用有待進一步驗證。miR-214可下調(diào)CSF1的表達,miR-214可能通過調(diào)控CSF1發(fā)揮了抑制胃癌細胞增殖、遷移浸潤的作用。
第二部分胃癌中CREB1的表達、預后價值及miRNA對其的調(diào)控作用
研究目的:
1.檢測CREB1在胃癌組織中的表達情況。
2.分析CREB1在胃癌中的臨床意義及預后價值。
3.驗證CREB1是否受到miR-214等miRN
9、A的調(diào)節(jié)。
研究方法:
1.免疫組化檢測185例原發(fā)灶胃癌組織、50例淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶胃癌組織、50例非腫瘤胃粘膜組織中CREB1蛋白的表達情況。
2.使用卡方檢驗分析CREB1表達與臨床病理參數(shù)的關系。Kaplan-Meier法及Log-rank檢驗分析CREB1表達與病人預后的關系。
3.使用miRWalk、starBase軟件預測可能調(diào)控CREB1的miRNA,通過熒光素酶實驗、Western
10、blot驗證miRNA對CREB1的調(diào)控作用。
結(jié)果:
1.CREB1在非腫瘤胃粘膜組織、胃癌原發(fā)灶、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶中呈遞增式表達。CREB1表達水平在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的組織相比于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的組織中明顯升高。
2.CREB1的高表達與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠處轉(zhuǎn)移、腫瘤分期正相關。
3.CREB1高表達的患者的總生存時間和無瘤生存時間明顯短于CREB1低表達的患者。CREB1與腫瘤分期聯(lián)合構(gòu)建的模型,是一個獨立
11、的預后因子。
4.CREB1是miR-27b和miR-200b的直接靶基因,受到miR-27b和miR-200b的負向調(diào)控。
結(jié)論及意義:
CREB1的高表達與胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、腫瘤分期和患者預后不良相關。miR-27b和miR-200b可負向調(diào)節(jié)CREB1的表達。CREB1是一個有價值的生物標記物,對胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、病人預后有重要提示作用。miR-27b/200b-CREB1信號通路可能為胃癌的治療提供新的
12、靶點。
第三部分 CREB1在胃癌中的功能及作用機制初探
研究目的:
1.探究CREB1在胃癌中的生物學功能。
2.鑒定轉(zhuǎn)錄因子CREB1的下游靶基因,初步探討CREB1的作用機制。
研究方法:
1.在胃癌細胞中過表達CREB1或干擾CREB1的表達,檢測其對細胞增殖、遷移浸潤能力的影響。
2.在胃癌細胞中,利用染色質(zhì)免疫共沉淀測序(Chromatin immunop
13、recipitationsequencing,ChIP-seq)分析轉(zhuǎn)錄因子CREB1在全基因組的結(jié)合譜,篩選CREB1可能調(diào)控的mRNA、miRNA、lncRNA。
3.在細胞轉(zhuǎn)染CREB1過表達質(zhì)?;駽REB1干擾RNA之后,使用實時定量PCR檢測CREB1下游候選lncRNA的表達水平。
4.使用ChIP-qPCR(染色質(zhì)免疫共沉淀-實時定量PCR)證實CREB1與lncRNA啟動子的結(jié)合。
結(jié)果:<
14、br> 1.過表達CREB1能夠促進胃癌細胞的增殖、遷移浸潤;反之,下調(diào)CREB1表達則抑制胃癌細胞的增殖、遷移浸潤。
2.ChIP-seq結(jié)果提示CREB1可以結(jié)合到831個mRNA、276個lncRNA、62個miRNA的啟動子區(qū)。
3.ChIP-seq的結(jié)果與本課題組前期做的胃癌轉(zhuǎn)移相關lncRNA芯片取交集,將候選lncRNA范圍縮減為9個。
4.通過實時定量PCR驗證,發(fā)現(xiàn)CREB1可正向調(diào)節(jié)l
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