人類全基因組Sp1結合區(qū)域甲基化與基因表達的關聯(lián)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、DNA甲基化是一種常見的表觀遺傳現象，也是表觀遺傳學研究的熱點之一。DNA甲基化就是指 DNA雙鏈上，CpG二核苷酸中的胞嘧啶在 DNA甲基轉移酶（DNMTs）作用下轉化成5-甲基胞嘧啶的現象。DNA甲基化可能對被甲基化的CpG位點附近的基因的表達產生抑制。Sp1是 Sp蛋白家族的一員，在其 C端含有鋅指結構域，能夠特異性識別 DNA上的GC盒從而參與多種組織中的轉錄調控。Sp1在DNA上的結合區(qū)域含有CpG位點，可能被DNA甲基轉移酶

2、甲基化。由于Sp1在多種基因的調控中都出現，因此其與DNA結合區(qū)域的甲基化可能對相關基因產生什么樣的影響便成為一個很有價值的問題。本實驗著眼于全基因組水平，結合來自于UCSC的TFBS Conserved Track中的Sp1的轉錄因子結合位點數據，以及人類表觀遺傳組計劃提供的6、20、22號染色體的甲基化數據，通過樸素貝葉斯分類方法構建全基因組Sp1結合位點甲基化狀態(tài)的預測模型，對全基因組范圍內1750個Sp1結合位點在兩種組織（CD

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