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文檔簡介
1、交互效應指兩個或多個因素相互依賴發(fā)生作用而產生的一種效應.當考慮的因素較多時,特別是當因素的個數遠大于樣本容量時,傳統(tǒng)的交互效應分析方法便不再適用,于是研究者致力于尋找新的統(tǒng)計方法和技術來解決高維數據的交互效應檢驗問題.
本文引入一種能夠勝任高維數據的交互效應檢驗方法,并將其應用于一個包含288只NMRI雄性小鼠的真實數據集中.針對該小鼠群體的4種與復雜疾病有關的性狀,包括:血糖含量(GLU),高密度脂蛋白膽固醇(HDL)
2、等,在全基因組范圍內進行交互效應檢測.探究SNPs位點之間或基因之間的交互效應對準確把握復雜疾病的發(fā)生與運行機制十分有益.
結果顯示,對于性狀甘油三脂水平(TRI),交互效應最顯著的單核苷酸多態(tài)位點(SNPs)為Chr5上73mb附近的rs33383056和Chr17上32mb附近的rs51655961,其P-值達到1.44E-05,并且位點rs33383056附近所對應的兩個基因Ociad2,Cwh43分別與位點rs51
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