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文檔簡介
1、不良的藥代動力學性質（吸收、分布、代謝和排泄，ADME）和毒性(T)是導致藥物開發(fā)失敗的主要原因之一，因此在藥物開發(fā)的早期階段對候選藥物分子的ADMET性質進行評估是至關重要的。ADMET實驗評估代價高，周期長，因此發(fā)展可靠的ADMET預測及虛擬高通量篩選模型具有非常重要的研究意義和重大的應用前景。本論文的研究主要目的是構建一個整合的ADMET數(shù)據(jù)信息系統(tǒng)PKKB(PharmacoKineticsKnowledgeBase)，同時利用P
2、KKB中的數(shù)據(jù)建立一組ADMET性質預測的簡單規(guī)則，以用于大型化合物庫的早期評價和預處理。
在論文的第一部分中，我們首先構建了一個整合的ADMET數(shù)據(jù)庫PKKB，其中包含藥物分子的二維和三維化學結構、藥理信息、實驗或計算的理化性質，以及高質量的ADMET性質相關的實驗數(shù)據(jù)。目前，PKKB中的ADMET相關實驗數(shù)據(jù)條目已超過10000條，是目前公開發(fā)布的信息量最大的ADMET實驗信息的在線數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。此外，PKKB中的大部分
3、數(shù)據(jù)已應用于由本課題組發(fā)展的ADMET預測模型。PKKB將不斷地進行更新和升級，為研究者提供最新的ADMET數(shù)據(jù)。
在第二部分中，我們建立了一組基于大量數(shù)據(jù)的ADMET性質預測的簡單規(guī)則。這一組規(guī)則是一整套基于化合物結構特征的指導原則，符合規(guī)則的化合物可能具有更好的ADMET特征。本研究所用數(shù)據(jù)均來自文獻和公共的數(shù)據(jù)庫，共計15935個不同的化合物，而且這些化合物結構多樣。我們首先計算了15個ADMET預測中常用的分子性質
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