一種基于錨定PCR的微衛(wèi)星篩選新方法的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、微衛(wèi)星是一種廣泛應用的遺傳標記。隨著研究的不斷深入,要求從基因組中大量篩選微衛(wèi)星位點。傳統(tǒng)的篩選方法雖然被普遍采用,但仍存在著許多缺點和不足,如需要構建基因文庫、內切酶的使用以及篩選出的位點重復率高等。文庫構建耗時、費力,且對技術、經驗要求較高;由于內切酶切點分布的隨機性,許多微衛(wèi)星位點克隆中僅保留極少部分側翼序列,因而無法設計引物;重復率高耗費了大量的經費和勞動力。本研究創(chuàng)建了一種基于錨定PCR的篩選方法,從東北虎基因組中篩選了大量的

2、微衛(wèi)星位點,有效克服了上述問題。 首先進行一個單引物PCR,在微衛(wèi)星重復區(qū)內設計單引物Str-ACN,并在引物3'末端錨定一個堿基。然后利用末端脫氧核糖核酸轉移酶在PCR產物的3'末端上加一poly-C結構。再利用另行設計的引物GG-N與Str-ACN配對進行雙引物擴增,擴增產物克隆測序后,得到的就是微衛(wèi)星位點的下游序列。根據(jù)此下游序列再設計一個引物Nest1,利用相同的原理向上游擴增,克隆測序得到上游序列,這樣就得到了完整的微

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