RXR藥效團模建和分子對接研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、RXR能以形成同源二聚體(RXR∶RXR)或與其它核受體(RAR、TR、VDR、LXR、FXR、PPARs、NGFIB)形成異源二聚體的形式調(diào)節(jié)多個基因轉(zhuǎn)錄。因此對多種核受體有調(diào)節(jié)作用，成為近幾年藥物開發(fā)的重要靶點之一。
　　 本實驗利用Catalyst軟件生成并研究了RXR(α，β，γ)激動劑和RXRα拮抗劑的三維藥效團模型。并利用DOCK軟件對RXR(α，β)激動劑與相應(yīng)受體進行了對接研究。
　　 RXRα激動劑最佳

2、模型包括四個藥效團元素(3個疏水團，1個氫鍵受體)和8個排除體積。分子對接結(jié)果顯示配體分子絕大部分處于受體的疏水區(qū)域，周圍有較多體積較大的氨基酸形成空間位阻，限制配體分子與受體結(jié)合，配體分子能與Ala332間形成氫鍵。藥效團模型能與分子對接結(jié)果很好地擬合，互相印證了結(jié)果的可靠性。
　　 RXRα拮抗劑的三維藥效團模型包括四個藥效團元素(3個疏水團，1個氫鍵受體，1個芳香環(huán))和5個排除體積。
　　 RXRβ激動劑的三維藥效

3、團模型包括四個藥效團元素(1個氫鍵受體，2個脂肪疏水團，1個芳香疏水團)和9個排除體積。分子對接結(jié)果顯示配體分子絕大部分處于受體的疏水區(qū)域，周圍有較多體積較大的氨基酸形成空間位阻，限制配體分子與受體結(jié)合，配體分子能與Ala398、Arg387間形成氫鍵。藥效團模型能與分子對接結(jié)果很好地擬合，互相印證了結(jié)果的可靠性。
　　 RXRγ激動劑的三維藥效團模型包括五個藥效團元素(1個氫鍵受體，3個脂肪疏水團，1個芳香疏水團)和5個排除體

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