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文檔簡介
1、計算機輔助藥物設計的理論的方法不斷走向成熟,開展生物大分子(受體)與先導化合物(配體)的相互作用機制、蛋白質三維結構預測等前沿領域的研究具有重要的理論意義和實用價值,并能加快發(fā)現(xiàn)創(chuàng)新藥物的步伐。本論文圍繞這些熱點課題,運用分子模擬技術,進行 HIV 蛋白酶和受體三維結構的預測、配體-受體相互作用機制的研究及藥物分子設計。 本論文共分四章: 第一章:簡述了計算機輔助藥物設計的基本方法和最新進展。 第二章:選擇PDB
2、數(shù)據(jù)庫中HIV蛋白酶復合物為研究對象,通過分子疊合、分子對接研究,預測出了這類抑制劑與已經上市的抗艾滋病的藥物Saquinavir之間的相似性和對HIV病毒蛋白酶的不同抑制作用。這些工作為基于HIV蛋白酶結構的藥物設計莫定了基礎。 第三章:選取一組高活性的HIV蛋白水解酶抑制劑為研究對象,通過定量構效關系的研究,得到了這類抑制劑的QSAR模型,建立了這類抑制劑的生物活性指標IC<,50>的預測模型,并成功地預測了三個同類抑制劑的
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