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1、西南農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文黃鱔促性腺激素釋放激素的cDNA克隆與序列分析姓名:方平申請學位級別:碩士專業(yè):水產(chǎn)養(yǎng)殖指導教師:李英文20050501西南農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文中文摘要黃鱔cGnRHII的eDNA核苷酸序列與鱸型目魚類的eGnRH—II基因在核苷酸序列上有著相當高的同源性,在氨基酸水平的同源性高于核苷酸水平的同源性,如:黃鱔cGnRHII前體氨基酸與舌齒鱸、條紋狼鱸、尼羅羅非魚、金頭鯛等鱸形目魚類cGnRH11前體氨基酸之間的相
2、似性很高,分別為86%、85%、88%、86%,與其它硬骨魚類如鰻鱺、青鯔、虹鱒、斑馬魚、擬鯉的相似性分別為68%、77%、75%、70%、71%,而與爬行綱的斑瞼虎、兩棲綱的牛蛙和哺乳綱的入相似性則比較低,均低于65%,分別是53%、63%、61%。將幾種代表不同脊椎動物類群的eGnRHII前體氨基酸序列比較發(fā)現(xiàn):cGnRHII前體的成熟十肽和蛋白水解位點是完全保守的,信號肽也是高度保守的,而聯(lián)接肽之閭的差異比較大。因此脊椎動物在長期
3、進化過程中,eGnRHIIeDNA的編碼特點、eGnRHII成熟肽和蛋白水解位點序列十分保守,而在不同進化分支脊椎動物之間,eQnRH—I【前體信號膚高度保守,而聯(lián)接膚的氨基酸序列差異程度比較大??傮w上來說,eGnRIIII蛋白的氨基酸序列在整個脊椎動物中都比較保守。4黃鱔eGnRHII基因推導蛋白的分析及其結(jié)構(gòu)預測預測eGnRHII基因編碼一個83個氨基酸的多肽鏈,分子量Mw=9375kDa,等電點pl=935。在氨基酸的組成上,以亮
4、氨酸含量最高,為193%;其次是絲氨酸、精氨酸和甘氨酸,均為96%:含量最低的氨基酸是蘇氨酸、天冬氨酸、苯丙氨酸和甲硫氨酸,均為12%??偟恼f來,cCfflRHII的氨基酸組成中堿性氨基酸略高于酸性氨基酸eGTIRH—II存在2個可能的跨膜結(jié)構(gòu)域,一個是4~17位的14個氨基酸殘基。另一個是68~75位的8個氨基酸殘基該蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)主要由四種形式組成,即m螺旋、隨機卷曲、p轉(zhuǎn)角和延伸鏈。以Ⅱ螺旋所占比例最高,為4819%。關(guān)鍵詞:黃
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