蠶豆EST-SSR分子標記的建立及其應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、蠶豆是世界上重要的豆科植物之一,是人類飲食中淀粉和蛋白質的重要來源,中國和歐洲是蠶豆主要的生產地。由于其部分交叉授粉,蠶豆具有高度異質性,因此品種間以及地方品種間包含了廣泛的遺傳變異,使保護種質資源變得更加昂貴和困難。盡管其種植歷史悠久并且有很高的經濟價值,但是對蠶豆分子標記仍然稀少。因此,在發(fā)展蠶豆更可靠更有效的分子標記將在多樣性分析和資源保護中起重要作用。
　　 EST-SSR分子標記在植物遺傳分析和育種研究中已成為一個有力

2、的工具。由于它從轉錄本推導,這些標記基因的SSR標記比傳統的分子標記占有優(yōu)勢:EST-SSR分子標記的開發(fā)更簡捷更廉價,相關物種具有較高的通用性,并更緊密地連接已知功能基因。
　　 我們下載了NCBI數據庫中公布的蠶豆5031條EST序列,通過對5031條EST序列進行拼接,得到Unigene1148條,通過SSR搜索軟件搜索到107個SSR位點,SSRs的出現頻率為9.32％。其中三核苷酸在107個SSR重復序列中是最為豐富的

3、重復類型,占44.86％。而在三核苷酸中AAG是最豐富的重復基元,占有12.5％。AG和TC是二核苷酸中最豐富的,各占33％。其它SSR重復類型所占比例相差不大。我們首次分離和鑒定了11個蠶豆EST-SSR分子標記其等位基因變異數為每個位點2-3,各多態(tài)性引物的PIC值變化范圍為0.06到0.43,平均PIC值為0.2919。在此基礎上,我們利用已開發(fā)的11個EST-SSR分子標記對來自中國和歐洲的29個品種進行主成分分析和聚類分析,結

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