蒺藜苜蓿6種光受體基因的預測和紫花苜蓿PHYB、CRY1、CRY2B、PHYA基因的克隆與分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、紫花苜蓿是一種重要的豆科牧草,其秋眠特性與抗寒性和生產性能相關。苜蓿秋眠是一種光周期反應。光敏色素和隱花色素等是光周期反應的受體。因而研究各種光受體與苜蓿秋眠性之間的聯(lián)系可能是揭示苜蓿秋眠性機理的有效途徑。 本研究采用生物信息學方法預測了蒺藜苜蓿的6種光受體基因,分別為光敏色素A、光敏色素B、隱花色素1、隱花色素2A、隱花色素2B和向光素1,涵蓋了目前主要的3種光受體。 以預測的蒺藜苜蓿光敏色素B、隱花色素1和隱花色素2

2、B為PCR引物設計模板,對紫花苜蓿相應基因進行了克隆測序。其中,紫花苜蓿光敏色素B最終得到7150bp的基因組序列和3425bp編碼序列(編碼1141aa),后者達到預測的蒺藜苜蓿PHYB基因編碼序列的99.0%;隱花色素1獲得4318bp的基因組序列和2030bp編碼序列(編碼676aa),達到預測的蒺藜苜蓿隱花色素1基因編碼序列的99.5%;隱花色素2B獲得2251bp的基因組序列和1453bp編碼序列(484aa),達到預測的蒺藜

3、苜蓿隱花色素2B基因編碼序列的80.3%。說明利用生物信息學方法預測蒺藜苜?;?,然后應用于紫花苜蓿研究的方法高效、可行。另外,本實驗對這3個基因的外顯子-內含子邊界及保守區(qū)進行了分析。 本實驗通過使用染色體步移法擴增得到了紫花苜蓿光敏色素A和光敏色素的5’端序列,長度分別為1309bp和1752bp,補齊了之前實驗所欠缺的5’端編碼序列。說明染色體步移法是一種獲取已知序列相鄰未知序列的有效方法。 通過使用一對擴增長度約

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