微陣列比較基因組雜交分析18等臂雙著絲粒染色體胎兒全基因組拷貝數變化

1、1微陣列比較基因組雜交分析微陣列比較基因組雜交分析1818等臂雙著絲粒染色體胎兒全等臂雙著絲粒染色體胎兒全基因組拷貝數變化的實驗研究基因組拷貝數變化的實驗研究張艷亮1，戴勇1，2，涂植光1，李啟運2，曾君2，林秀華2，張麗21重慶醫(yī)科大學教育部臨床檢驗診斷學重點實驗室，重慶市，4000162暨南大學第二臨床醫(yī)學院（深圳市人民醫(yī)院），深圳市，518082【摘要摘要】目的目的了解18q等臂雙著絲粒染色體[idic(18)(p11→qter)

2、]胎兒全基因組拷貝數變化的情況，確定idic(18)(p11→qter)的結構和組成，探討微陣列比較基因組雜交在分子細胞遺傳診斷中運用的可行性和優(yōu)越性。方法方法運用微陣列比較基因組雜交芯片對一被傳統G顯帶和熒光原位雜交診斷為idic(18)(p11→qter)的胎兒進行全基因組高分辯率掃描和分析。結果結果微陣列比較基因組雜交顯示胎兒存在18p11.21→pter缺失，18p11.21→qter復制，斷裂點位于12104527和12145

3、199（距離18p端粒），確定idic(18)(p11→qter)是idic(18)(p11.21→qter)。另外，還檢測出了21個亞顯微拷貝數變化。結論結論與傳統的細胞遺傳分析方法相比，微陣列比較基因組雜交不僅能準確、高分辯率和高通量地檢測出基因組拷貝數變化，還能高分辯率地確定拷貝數變化的斷裂點。【關鍵詞關鍵詞】微陣列比較基因組雜交；18等臂雙著絲粒染色體；拷貝數變化中圖分類號中圖分類號:R3943Experimentalstudy

4、ofwholegenomiccopynumbervariationsinafetuswithadenovoisodicentricchromosome18byarraybasedcomparativegenomichybridizationZhangYanLiang1DaiYong12TuZhiGuang1LiQiYun2ZengJun2LinXiuHua2ZhangLi21KeyLabatyofLabatyMedicalDiagnos

5、ticsMinistryofEducation通訊作者:戴勇，暨南大學第二臨床醫(yī)學院（深圳市人民醫(yī)院），深圳市，518082。電話：0755255330182780。傳真：075525626750。Email:daiyong22@.cn。insituhybridizationFISH）、實時定量PCR（realtimequantitativePCR，RTqPCR）、多重連接介導的探針擴增（multiplexligationdepende

6、ntprobeamplificationMLPA）和比較基因組雜交（comparativegenomichybridizationCGH）等都能用于CNVs的檢測和描述，但這些技術要么由于分辯率低，難以檢測亞顯微CNVs，更難以確定CNVs的大小和斷裂點；要么由于低通量性，僅能對有限的基因組位點進行分析，無法對整個基因組進行篩查。最近，微陣列比較基因組雜交（arraybasedcomparativegenomichybridizatio

7、n，arrayCGH）作為一種新型的強大的細胞遺傳分析方法出現了，為細胞遺傳診斷和研究提供了一個新的平臺。ArrayCGH與傳統CGH的原理相似，但用吸附于固體載體（如玻片）上的大量DNA探針取代了中期染色體，分辨率達到了空前的高度。因此，ArrayCGH結合了傳統CGH高通量和FISH高分辨率等優(yōu)點，一次檢測相當于對基因組同時進行了成千上萬個獨立的FISH。本文運用arrayCGH對一嚴重四肢畸形和心臟缺陷、傳統細胞遺傳診斷為18q等

8、臂雙著絲粒染色體[idic(18)(p11→qter)]的胎兒進行全基因組掃描，了解胎兒全基因組CNVs的情況，探討arrayCGH在分子細胞遺傳診斷中運用的可行性和優(yōu)越性。材料和方法材料和方法1病例資料一28歲孕3產0漢族孕婦，此次妊娠26w時，超聲檢查發(fā)現胎兒雙側橈骨缺失并雙手畸形，雙側肱骨較短，右側足內翻，TaussingBing綜合征（室間隔缺損，肺動脈騎跨），雙側脈絡膜囊腫，頸項軟組織增厚。否認近親結婚，否認高血壓、糖尿病、腎