生物信息學(xué) 期末復(fù)習(xí)

1、■一、選擇題:1.以下哪一個(gè)是mRNA條目序列號(hào)：A.J01536■.NM_15392C.NP_52280D.AAB1345062.確定某個(gè)基因在哪些組織中表達(dá)的最直接獲取相關(guān)信息方式是：■.UnigeneB.EntrezC.LocusLinkD.PCR3.一個(gè)基因可能對(duì)應(yīng)兩個(gè)Unigene簇嗎？■可能B.不可能4.下面哪種數(shù)據(jù)庫(kù)源于mRNA信息：■dbESTB.PDBC.OMIMD.HTGS5.下面哪個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)面向人類疾病構(gòu)建：A.ES

2、TB.PDB■.OMIMD.HTGS6.Refseq和GenBank有什么區(qū)別：A.Refseq包括了全世界各個(gè)實(shí)驗(yàn)室和測(cè)序項(xiàng)目提交的DNA序列B.GenBank提供的是非冗余序列■.Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D.GenBank源于Refseq7.如果你需要查詢文獻(xiàn)信息，下列哪個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是你最佳選擇：A.OMIMB.Entrez■PubMedD.PROSITE8.比較從Entrez和ExPASy中提取有關(guān)蛋白質(zhì)序列

3、信息的方法，下列哪種說法正確：A.因?yàn)镚enBank的數(shù)據(jù)比EMBL更多，Entrez給出的搜索結(jié)果將更多B.搜索結(jié)果很可能一樣，因?yàn)镚enBank和EMBL的序列數(shù)據(jù)實(shí)際一樣■搜索結(jié)果應(yīng)該相當(dāng)，但是ExPASy中的SwissProt記錄的輸出格式不同9.天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的單字母代碼分別對(duì)應(yīng)于：■NWYB.QWYC.FWYD.QNW10.直系同源定義為：■不同物種中具有共同祖先的同源序列B.具有較小的氨基酸一致性但是有較大的結(jié)構(gòu)

4、相似性的同源序列C.同一物種中由基因復(fù)制產(chǎn)生的同源序列D.同一物種中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列11.下列那個(gè)氨基酸最不容易突變：A.丙氨酸B.谷氨酰胺C.甲硫氨酸■半胱氨酸12.PAM250矩陣定義的進(jìn)化距離為兩同源序列在給定的時(shí)間有多少百分比的氨基酸發(fā)生改變：A.1%B.20%■.80%D.250%13.下列哪個(gè)句子最好的描述了兩個(gè)序列全局比對(duì)和局部比對(duì)的不同：A.全局比對(duì)通常用于比對(duì)DNA序列，而局部比對(duì)通常用于比對(duì)蛋

5、白質(zhì)序列B.全局比對(duì)允許間隙，而局部比對(duì)不允許C.全局比對(duì)尋找全局最大化，而局部比對(duì)尋找局部最大化■全局比對(duì)比對(duì)整體序列，而局部比對(duì)尋找最佳匹配子序列14.假設(shè)你有兩條遠(yuǎn)源相關(guān)蛋白質(zhì)序列。為了比較它們，最好使用下列哪個(gè)BLOSUM和PAM矩陣：■BLOSUM45和PAM250B.BLOSUM45和PAM1C.BLOSUM80和PAM250D.BLOSUM10和PAM115.與PAM打分矩陣比較，BLOSUM打分矩陣的最大區(qū)別是：A.最好

6、用于比對(duì)相關(guān)性高的蛋白B.它是基于近相關(guān)蛋白的全局多序列比對(duì)■它是基于遠(yuǎn)相關(guān)蛋白的局部多序列比對(duì)D.它結(jié)合了全局比對(duì)和局部比對(duì)32.下列具有最小基因組的原核生物可能是：A.嗜極生物B.病毒■胞內(nèi)細(xì)菌D.桿菌33.要證明某大腸桿菌中的某個(gè)基因是水平轉(zhuǎn)移而來，需要：A.分析該大腸桿菌中該基因的GC含量與其他基因是否有很大差異B.分析該大腸桿菌中該基因的密碼子使用與其他基因是否有很大差異C.系統(tǒng)發(fā)生分析該基因與其他物種中基因的同源關(guān)系■獲取以

7、上三個(gè)方面的信息34.C值矛盾是指：A.某些基因組中核苷酸C的含量少B.真核生物基因組大小同編碼蛋白質(zhì)的基因個(gè)數(shù)沒有相關(guān)性■真核生物基因組大小同屋中的復(fù)雜性相關(guān)性很小D.真核生物基因組大小同進(jìn)化上的年齡相關(guān)性小35.成百上千個(gè)4~8bp的重復(fù)序列單元最可能出現(xiàn)在：A.散布性重復(fù)序列中B.假基因中■端粒中D.片段復(fù)制區(qū)域36.從頭預(yù)測(cè)真核基因的原因有：A.外顯子內(nèi)含子邊界難以確定B.內(nèi)含子長(zhǎng)度可能只有幾個(gè)堿基對(duì)C.編碼區(qū)域的GC含量并不總

8、是與非編碼區(qū)相同■以上三個(gè)方面的原因37.人類基因組大小大約是多少M(fèi)b：A.130B.300■3000D.3000038.各種重復(fù)元件在人類基因組中大約占的百分比為：A.5%B.25%■50%D.95%39.蛋白質(zhì)編碼區(qū)域占人類基因組百分比是：■15%B.510%C.1020%D.204%40.人類基因組中GC含量高的區(qū)域：A.基因密度相對(duì)較低■基因密度相對(duì)較高C.基因密度多變D.基因所含密碼子相對(duì)較少41.人類復(fù)合孟德爾遺傳的基因疾病

9、約占疾病基因的：■1%B.10%C.50%D.60%42.單基因疾病趨向于：■在普通人群較少見，并且發(fā)生時(shí)間較早B.在普通人群較常見，并且發(fā)生時(shí)間較早C.在普通人群較少見，并且發(fā)生時(shí)間較晚D.在普通人群較常見，并且發(fā)生時(shí)間較晚名詞解釋1.生物信息學(xué)（bioinfmatics）：是一門結(jié)合生物技術(shù)和信息技術(shù)從而揭示生物學(xué)中新原理的科學(xué)。2.鳥槍法測(cè)序（shotgunmethod）一種測(cè)序方法，包括從基因組中獲得隨機(jī)的、已測(cè)序的克隆片段，并

10、且對(duì)初始基因的位置一無所知。3.BLAST：基本局部相似性比對(duì)搜索工具。在序列數(shù)據(jù)庫(kù)中快速查找與給定的序列具有最優(yōu)局部對(duì)準(zhǔn)結(jié)果的序列的一種序列對(duì)算法。4.整體聯(lián)配（globalalignment）：對(duì)兩個(gè)核苷酸或蛋白質(zhì)序列的全長(zhǎng)所進(jìn)行的比對(duì)。5.FASTA：是第一個(gè)被廣泛使用的數(shù)據(jù)庫(kù)相似性搜索算法，這個(gè)程序通過掃描序列中“詞”的小配對(duì)，從而尋找最優(yōu)局部比對(duì)。6.算法（algithm）：在計(jì)算機(jī)程序中包含的一種固定過程。7.序列比對(duì)（al

11、ignment）：將兩個(gè)或多個(gè)序列排在一起，以達(dá)到最大一致性的過程（對(duì)于氨基酸序列是比較他們的保守性），這樣評(píng)估序列間的相似性和同源性。8.多序列比對(duì)（multiplesequencealignment）：三個(gè)或多個(gè)序列之間的比對(duì)，如果序列在同一列有相同結(jié)構(gòu)位置的殘基和（或）祖?zhèn)鞯臍埢瑒t會(huì)在該位置插入空位。9.最佳聯(lián)配（optimalalignment）：兩個(gè)序列之間有最高打分值的排列。10.空位（gap）：在兩條序列比對(duì)過程中需要在