基于距離方法的病毒系統(tǒng)發(fā)育關系研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著人類基因組計劃的完成,生物序列數(shù)據(jù)與日俱增,分析和處理海量的生物數(shù)據(jù),從中提取對人類有價值的信息.這些工作成為生物信息學首要的研究內容.本文的工作主要是:通過對數(shù)關聯(lián)距離和互信息距離來分析30種細小病毒和124種dsDNA病毒的系統(tǒng)發(fā)育關系.
　　本文主要分四個部分組成.第一部分,主要介紹生物信息學的概念、生物信息學的研究對象和研究內容.同時介紹了生物信息學中常用的數(shù)學方法和模型以及病毒的相關基本知識.
　　第二部分,基

2、于統(tǒng)計和信息論兩個方面,提出了兩種距離(對數(shù)關聯(lián)距離和互信息距離).另外,還簡要地解釋了這兩種距離用于物種系統(tǒng)發(fā)育分析的原因.
　　第三部分,利用提出的兩種新距離分別處理和分析30種細小病毒和124種dsDNA病毒的完全基因組序列,分別構建它們的系統(tǒng)發(fā)育樹.在30種細小病毒和124種dsDNA病毒的系統(tǒng)發(fā)育分析中,獲得了與傳統(tǒng)的系統(tǒng)發(fā)生樹相一致的樹,綜合以前的分析和結果,在系統(tǒng)發(fā)育分析研究中提出的算法和模型是可靠的、穩(wěn)定的.同時,

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