基于DNA條形碼的瀕危木材識別技術研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著全球森林資源貿易量的急劇增加,木材尤其是熱帶木材物種已迅速成為《瀕危野生動植物種國際貿易公約》(CITES)近年來關注的焦點。開展木材識別技術研究,實現(xiàn)其科學與準確識別,是保護瀕危木材資源的關鍵技術基礎。僅依靠傳統(tǒng)木材解剖技術,一般只能識別木材到“屬”或“類”,無法實現(xiàn)“種”的識別。最新發(fā)展的木材DNA條形碼識別技術為解決這一科學難題提供了可能。盡管植物DNA提取與分析技術已日趨成熟,但對于經過干燥加工或長期存儲的木材,則很難獲得高

2、質量的DNA。本論文針對干燥處理或長期存儲的木材組織,通過突破DNA高效提取技術瓶頸,并優(yōu)選確定DNA條形碼,以實現(xiàn)瀕危木材“種”的識別。
  本研究通過優(yōu)化溫浴時間、木粉量與DNA裂解液體積比、裂解液化學成分等技術參數(shù),改進了木材DNA提取技術;并定量比較改進的CTAB法與改進的Qiagen試劑盒法,優(yōu)選了木材DNA提取方案,初步建立了木材DNA提取技術體系。利用聚合酶鏈式反應(PCR),對多條短DNA片段進行擴增;通過BLAS

3、T序列比對及構建系統(tǒng)進化樹,優(yōu)選確定了適用于木材識別的DNA條形碼類型及片段長度,并分析了干燥處理及存儲時間等因素對木材DNA的影響?;诤Y選確定的DNA條形碼,實現(xiàn)了瀕危木材“種”的科學準確識別,推動了木材識別新技術的發(fā)展,同時也為我國提高CITES公約履約能力提供了關鍵技術支撐。
  主要結果歸納如下:
  (1)初步建立了以改進的Qiagen試劑盒法為基礎的木材DNA提取技術體系。本研究以杉木(Cunninghamia

4、 lanceolata(Lamb.) Hook.)為實驗對象,采用延長木粉溫浴時間、減小木粉量與DNA裂解液體積比、優(yōu)化裂解液的化學成分、多份DNA裂解液過同一DNA吸附柱等改進措施,形成了優(yōu)化的木材DNA提取技術。同時,確定了改進的Qiagen試劑盒DNA提取方法優(yōu)于改進的CTAB法。研究結果為進一步開展木材DNA識別工作提供了高效DNA提取技術基礎。
  (2)確定了木材不同徑向位置對DNA提取的影響。從木材邊材到心材,DNA

5、含量呈減少趨勢;從木材邊材和心邊材過渡區(qū)提取的DNA純度通常高于心材DNA。
  (3)針對80℃和120℃不同溫度干燥處理的白木香(Aquilaria sinensis(Lour.) Gilg)木材,采用改進的Qiagen試劑盒法進行木材DNA提取,分析了干燥處理對木材DNA的影響。經過80℃干燥處理后的木材邊材及心材,長度為300-500 bp的葉綠體及細胞核核糖體DNA片段依然能PCR擴增成功;但經過120℃干燥處理后,木材

6、邊材葉綠體及細胞核核糖體DNA片段能成功擴增,而心材DNA片段卻未擴增成功。高溫加速DNA分子鏈酶解、水解及氧化反應,導致DNA降解成小片段分子,需擴增目的片段可能被降解。
  (4)選取30年、57年、80年和3600年等不同存儲年限的胡楊(Populus euphraticaOliv.)木材,通過PCR擴增一系列不同長度的DNA片段,評估了不同存儲時間木材DNA的保存狀況。對于存儲30年的木材標本,長度為100-800 bp之

7、間的DNA片段均能PCR擴增成功;存儲57年的木材標本,僅長度200 bp左右或更短的葉綠體DNA片段成功擴增;存儲80年的木材標本,僅長度100 bp左右的葉綠體DNA片段成功擴增;而對于存儲3600年的考古木材,即使長度約100 bp的葉綠體DNA片段也未擴增成功。隨著存儲時間的延長,由于水解反應、氧化反應以及微生物分解作用,木材DNA逐漸降解成小片段分子。
  (5)篩選確定了適用于木材識別的DNA條形碼類型及片段長度。針對

8、不同樹種及不同存儲狀況的木材,應選擇適于鑒別物種的不同類型及長度的DNA條形碼。本研究中,能有效識別白木香木材的DNA條形碼為trnL-trnF和ITS1;DNA條形碼rbcL及ITS或者多個短DNA條形碼組合適用于鑒別胡楊木材;DNA條形碼trnL比matK和psbA-trn更適用于區(qū)分微凹黃檀(Dalbergia retusa Hemsl.)、危地馬拉黃檀(Dalbergia tucurensisDonn.Sm.)及交趾黃檀(Dal

9、bergia cochinchinensis Pierre)這3種黃檀屬木材的識別條形碼。此外,綜合木材DNA降解和DNA片段識別信息位點數(shù)等因素,建議選擇的DNA條形碼長度為200-500 bp。
  (6)基于DNA條形碼技術可成功實現(xiàn)木材“種”的準確識別。通過優(yōu)選的DNA條形碼構建最大簡約樹或鄰接樹等系統(tǒng)進化樹,能夠實現(xiàn)瀕危樹種白木香木材,長期存儲胡楊木材,及微凹黃檀、危地馬拉黃檀和交趾黃檀等3種瀕危黃檀屬木材“種”的識別。

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