GBM強化與壞死的比例(C∶N)與信號傳導通路相關性的研究.pdf

1、目的: 探討多形性膠質母細胞瘤（GBM）的磁共振（magnetic resource imaging，MRI）增強圖像特征中強化與壞死比例的高低與腫瘤信號傳導通路之間的相關性。
　　 方法: 收集徐醫(yī)附院病理證實為WHO Ⅳ級的GBM（C:N）的腫瘤標本6例及磁共振圖像，腫瘤標本取出后立即投入液氮中保存。采用Unizol法分別提取總RNA，經驗證RNA沒有降解后經純化后制備成cRNA與illumina芯片雜交，通過FDR法以及基

2、因芯片的雙倍信號為雙重標準篩選出腫瘤差異表達基因。以C:N（≤1.0、1.0-3.0、≥3.0）比例為秩次，基因表達高低為秩次，通過Spearman等級相關分析C:N與差異基因表達的相關性，尋找隨C:N比例增高而增高或降低的相關基因，將實驗數(shù)據(jù)與信號傳導通路的生物學數(shù)據(jù)庫KEGG等數(shù)據(jù)庫相連接，行Pathway分析。
　　 結果:
　　 1、通過Spearman等級相關分析，各從其中挑選9條基因，C:N比例與下列幾個基因

3、呈正相關關系：G1-S-specific cyclin E、Cytoplasmic nuclear factor of activated T cells、EGFR、IGFBP-1、 OX40 ligand 、Cysteine protease 、Endothelin receptor type B 、Nuclear factor I–X、 Cyclin D2。
　　 2、C:N比例與下列幾個基因呈負相關關系：Ras-relat

4、ed protein RAB3A、DNAse I-like、Akt、DNA ligase IV、Estrogen Sulfotransferase、Transforming growth factor-α、Muscle-specific DNAse I-like、Ephrin type A receptor 1、Inhibitor DNA binding- 4。
　　 3、通過聯(lián)系文獻及數(shù)據(jù)庫，EGFR signal pathw

5、ay 的基因表達與C:N的比例成正相關關系。Ras-raf signal pathway、PI3K-Akt-NF-κBsignal pathway的基因表達與C:N的比例成負相關關系。
　　 結論:
　　 1、GBM實質與壞死比例(C:N)與腫瘤的EGFR信號傳導通路成正相關關系，當C:N比例較高時針對EGFR信號傳導通路的個體化治療可能能改善預后。
　　 2、GBM實質與壞死比例(C:N)與細胞內Ras，PI3